Elucidating a Component of the HIV Virus

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An advance in AIDS research — Researchers at the University of Illinois in Urbana-Champaign (UIUC) have fully reproduced the structure of the capsid, the protective shell for genetic material in the HIV virus that opens to release material into cells. This capsid is an assemblage of 1,300 proteins, representing 64 million atoms. It is one of biggest atom-level simulations ever carried out. All that was known of this capsid were the parts observed experimentally using tomography, nuclear magnetic resonance, etc. Elucidating its complete structure should help improve understanding of the mechanics of HIV virus action, and work out new techniques to fight it. But in order to achieve this, researchers had to wait for a generation of supercomputers possessing power in excess of petaflops, such as the Blue Waters supercomputer at the National Center for Supercomputing Applications (NCSA), which is one of the most powerful computers in the world. The American team designed a[…]
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